每年四月至五月為元智大學學生自治組織改選時間，元智大學學生會選舉委員會依照相關規定辦理選舉。

學生會選舉事項

系（班）學會選舉事項

學生會選舉委員會協助系（班）學會辦理選舉。選舉事項及當選門檻由各系（班）定之。

學生會正副會長選舉

以全校為單一選舉區進行選舉，採聯名選舉，應選一組。
學生會正副會長選舉有當選門檻，應額參選同意票應達全體投票權人之5%；參選組別為二組（含）以上，採簡單多數決。

學生會學生議員選舉

以各院為選舉區進行選舉，採個人選舉，應選名額不一。每院保障席次二席，四百人以上學院，自第四百人起，每增加四百人增加一席。
學生會學生議員選舉有當選門檻，有效得票應達該學院全體投票權人3％，並透過票數由高至低，依序、依名額當選。

不分區校務會議學生代表

以全校為單一選舉區進行選舉，採個人選舉，應選名額待定。
不分區校務會議學生代表不設置門檻，採簡單多數決。